Детская инфекционная больница была открыта в 1937 году в г. Краснодаре по улице Ярмарочной ныне улица В.Головатого.

В 1972 году по решению исполкома горсовета было начато строительство нового здания детской инфекционной больницы по ул. Красных Партизан 6/5. Введенно в эксплуатацию в 1976 г., где и находится по настоящее время.

До 2005 года Детская инфекционная больница была муниципальным учреждением здравоохранения города Краснодара.

С 25 мая 2005 года больница передана в государственную собственность с функцией специализированного клинического детского инфекционного учреждения.

Больница располагается на 4 га земли, в зеленой зоне, где произрастает свыше 500 деревьев хвойных и лиственных пород, среди которых имеются редкие и ценные виды.

Рядом с лечебным корпусом оборудована детская игровая площадка.

Главная цель - осуществление госпитализации всех обратившихся за медицинской помощью при наличии показаний.

Оснащено компьютерной техникой и имеет локальную связь со всеми структурными подразделениями больницы.